Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Subh2bvQ9D9Z7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Subh2bvQ9D9Z7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms