Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actrt2Q9D9L5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actrt2Q9D9L5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actrt2Q9D9L5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actrt2Q9D9L5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actrt2Q9D9L5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Actrt2Q9D9L5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt2Q9D9L5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt2Q9D9L5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actrt2Q9D9L5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms