Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Actrt1Q9D9J3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actrt1Q9D9J3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Actrt1Q9D9J3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Actrt1Q9D9J3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actrt1Q9D9J3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms