Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Borcs5Q9D920 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Borcs5Q9D920 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs5Q9D920 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs5Q9D920 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Borcs5Q9D920 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms