Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifrd2Q9D8U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifrd2Q9D8U0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifrd2Q9D8U0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifrd2Q9D8U0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms