Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chmp5Q9D7S9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Chmp5Q9D7S9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chmp5Q9D7S9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chmp5Q9D7S9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms