Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnbd2Q9D5U8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnbd2Q9D5U8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cnbd2Q9D5U8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnbd2Q9D5U8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnbd2Q9D5U8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms