Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zcchc13Q9D548 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Zcchc13Q9D548 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zcchc13Q9D548 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zcchc13Q9D548 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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