Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tomm20lQ9D4V6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tomm20lQ9D4V6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tomm20lQ9D4V6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tomm20lQ9D4V6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms