Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc83Q9D4V3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc83Q9D4V3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc83Q9D4V3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc83Q9D4V3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc83Q9D4V3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms