Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4931428L18RikQ9D4S9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4931428L18RikQ9D4S9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4931428L18RikQ9D4S9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4931428L18RikQ9D4S9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms