Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc105Q9D4K7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc105Q9D4K7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc105Q9D4K7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc105Q9D4K7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc105Q9D4K7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc105Q9D4K7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc105Q9D4K7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms