Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrp2bpQ9D4C6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrp2bpQ9D4C6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrp2bpQ9D4C6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrp2bpQ9D4C6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrp2bpQ9D4C6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrp2bpQ9D4C6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrp2bpQ9D4C6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrp2bpQ9D4C6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrp2bpQ9D4C6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrp2bpQ9D4C6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms