Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cfap53Q9D439 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cfap53Q9D439 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cfap53Q9D439 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cfap53Q9D439 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cfap53Q9D439 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cfap53Q9D439 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cfap53Q9D439 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms