Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
5430402E10RikQ9D3N5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430402E10RikQ9D3N5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
5430402E10RikQ9D3N5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5430402E10RikQ9D3N5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
5430402E10RikQ9D3N5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5430402E10RikQ9D3N5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430402E10RikQ9D3N5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430402E10RikQ9D3N5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5430402E10RikQ9D3N5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms