Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mrpl28Q9D1B9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl28Q9D1B9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl28Q9D1B9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl28Q9D1B9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms