Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem53Q9D0Z3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem53Q9D0Z3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem53Q9D0Z3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem53Q9D0Z3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms