Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl52Q9D0Y8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl52Q9D0Y8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mrpl52Q9D0Y8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl52Q9D0Y8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms