Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdca7Q9D0M2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdca7Q9D0M2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdca7Q9D0M2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdca7Q9D0M2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdca7Q9D0M2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdca7Q9D0M2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdca7Q9D0M2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms