Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX2

Cep89, Centrosomal protein of 89 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep89Q9CZX2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep89Q9CZX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep89Q9CZX2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep89Q9CZX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep89Q9CZX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep89Q9CZX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep89Q9CZX2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep89Q9CZX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep89Q9CZX2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep89Q9CZX2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep89Q9CZX2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep89Q9CZX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep89Q9CZX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cep89Q9CZX2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cep89Q9CZX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cep89Q9CZX2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cep89Q9CZX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cep89Q9CZX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep89Q9CZX2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep89Q9CZX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cep89Q9CZX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms