Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mis18aQ9CZJ6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mis18aQ9CZJ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mis18aQ9CZJ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mis18aQ9CZJ6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Mis18aQ9CZJ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mis18aQ9CZJ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mis18aQ9CZJ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms