Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snf8Q9CZ28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snf8Q9CZ28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snf8Q9CZ28 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snf8Q9CZ28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snf8Q9CZ28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms