Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmem39aQ9CYC3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem39aQ9CYC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmem39aQ9CYC3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem39aQ9CYC3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmem39aQ9CYC3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmem39aQ9CYC3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms