Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ska2Q9CR46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ska2Q9CR46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ska2Q9CR46 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ska2Q9CR46 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ska2Q9CR46 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ska2Q9CR46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ska2Q9CR46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ska2Q9CR46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ska2Q9CR46 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms