Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifitm3Q9CQW9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifitm3Q9CQW9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifitm3Q9CQW9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifitm3Q9CQW9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms