Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncbp2Q9CQ49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncbp2Q9CQ49 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ncbp2Q9CQ49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ncbp2Q9CQ49 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ncbp2Q9CQ49 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncbp2Q9CQ49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms