Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NenfQ9CQ45 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NenfQ9CQ45 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NenfQ9CQ45 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NenfQ9CQ45 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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NenfQ9CQ45 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NenfQ9CQ45 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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NenfQ9CQ45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NenfQ9CQ45 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NenfQ9CQ45 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms