Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rpl17Q9CPR4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpl17Q9CPR4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpl17Q9CPR4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpl17Q9CPR4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpl17Q9CPR4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpl17Q9CPR4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
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