Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe41Q99PV5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bhlhe41Q99PV5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bhlhe41Q99PV5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bhlhe41Q99PV5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe41Q99PV5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bhlhe41Q99PV5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms