Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PpifQ99KR7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PpifQ99KR7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpifQ99KR7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms