Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lims1Q99JW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lims1Q99JW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lims1Q99JW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lims1Q99JW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lims1Q99JW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims1Q99JW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims1Q99JW4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims1Q99JW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims1Q99JW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims1Q99JW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lims1Q99JW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms