Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddb2Q99J79 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddb2Q99J79 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddb2Q99J79 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddb2Q99J79 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddb2Q99J79 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms