Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Spdl1Q923A2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Spdl1Q923A2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Spdl1Q923A2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Spdl1Q923A2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Spdl1Q923A2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Spdl1Q923A2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Spdl1Q923A2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms