Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Med28Q920D3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med28Q920D3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Med28Q920D3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Med28Q920D3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms