Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc9Q8VC31 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc9Q8VC31 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc9Q8VC31 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc9Q8VC31 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc9Q8VC31 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms