Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap2Q8R574 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap2Q8R574 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap2Q8R574 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap2Q8R574 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpsap2Q8R574 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpsap2Q8R574 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpsap2Q8R574 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpsap2Q8R574 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpsap2Q8R574 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpsap2Q8R574 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpsap2Q8R574 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpsap2Q8R574 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpsap2Q8R574 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpsap2Q8R574 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpsap2Q8R574 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms