Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
E2f4Q8R0K9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
E2f4Q8R0K9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E2f4Q8R0K9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
E2f4Q8R0K9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
E2f4Q8R0K9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2f4Q8R0K9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
E2f4Q8R0K9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2f4Q8R0K9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2f4Q8R0K9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2f4Q8R0K9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2f4Q8R0K9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2f4Q8R0K9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2f4Q8R0K9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms