Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spata4Q8K3V1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spata4Q8K3V1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata4Q8K3V1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata4Q8K3V1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata4Q8K3V1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms