Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrip1Q8CBD1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrip1Q8CBD1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrip1Q8CBD1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrip1Q8CBD1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nrip1Q8CBD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrip1Q8CBD1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrip1Q8CBD1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrip1Q8CBD1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrip1Q8CBD1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms