Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ppfibp1Q8C8U0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ppfibp1Q8C8U0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ppfibp1Q8C8U0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ppfibp1Q8C8U0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ppfibp1Q8C8U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms