Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tyw3Q8BSA9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tyw3Q8BSA9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tyw3Q8BSA9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tyw3Q8BSA9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tyw3Q8BSA9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms