Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gpc2Q8BKV1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gpc2Q8BKV1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gpc2Q8BKV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpc2Q8BKV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpc2Q8BKV1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gpc2Q8BKV1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpc2Q8BKV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gpc2Q8BKV1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms