Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK06

Fbxo9, F-box only protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo9Q8BK06 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo9Q8BK06 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo9Q8BK06 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo9Q8BK06 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo9Q8BK06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxo9Q8BK06 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo9Q8BK06 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo9Q8BK06 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo9Q8BK06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo9Q8BK06 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo9Q8BK06 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo9Q8BK06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo9Q8BK06 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo9Q8BK06 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo9Q8BK06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms