Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1cQ7TSF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1cQ7TSF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dsg1cQ7TSF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1cQ7TSF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Dsg1cQ7TSF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1cQ7TSF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms