Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LcorQ6ZPI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LcorQ6ZPI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LcorQ6ZPI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LcorQ6ZPI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LcorQ6ZPI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LcorQ6ZPI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms