Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gja6Q6S5G4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gja6Q6S5G4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gja6Q6S5G4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gja6Q6S5G4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gja6Q6S5G4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gja6Q6S5G4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gja6Q6S5G4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Gja6Q6S5G4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gja6Q6S5G4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gja6Q6S5G4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gja6Q6S5G4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms