Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NfrkbQ6PIJ4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NfrkbQ6PIJ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NfrkbQ6PIJ4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NfrkbQ6PIJ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NfrkbQ6PIJ4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NfrkbQ6PIJ4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms