Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dhx40Q6PE54 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dhx40Q6PE54 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dhx40Q6PE54 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dhx40Q6PE54 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx40Q6PE54 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms