Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vstm2lQ6PDS0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vstm2lQ6PDS0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm2lQ6PDS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm2lQ6PDS0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm2lQ6PDS0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms