Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarcc2Q6PDG5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarcc2Q6PDG5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarcc2Q6PDG5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smarcc2Q6PDG5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smarcc2Q6PDG5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms